С фитопланктона начинается пищевая цепочка, так как он служит пищей для зоопланктона. Мелких беспозвоночных поедает молодь леща, тарани, тюльки, хамсы и судака.
Для развития фитопланктона требуются вещества, приносимые в море речным стоком. В 2018 г. впервые за двадцать лет случился очень высокий весенний сток воды из Дона, который в несколько раз превысил обычный объем.
Исследования сотрудников АзНИИ показали, что уровень продуцирования органических веществ фитопланктоном повысился на 61%, что напрямую связано с опреснением акватории залива вследствие паводка.
Поэтому, «цветение воды» в Азовском море является важнейшим фактором в переработке органических веществ и пищевой цепочки от фитопланктона к рыбе.