Во время проверки выяснилось, что организации ведущие дноуглубительные работы не согласовали свои действия ни с Росрыболовством (на предмет влияния на водные биоресурсы), ни с министерством природных ресурсов (водопользование). С Кубанским бассейновым водным управлением не согласована программа ведения регулярных наблюдений за рекой и ее водоохранной зоной.
Параллельно с работами по расчистке дна и берегов реки производилась незаконная добыча песчано-гравийной смеси.
Специалисты Росрыболовства пришли к выводу, что работы нанесли ущерб пищевым водным организмам. Расчетный ущерб составляет 20,6 млн.руб.
Возбуждено уголовное дело по ст. 257 УК РФ (осуществление взрывных и иных работ, а равно эксплуатация водозаборных сооружений и перекачивающих механизмов с нарушением правил охраны водных биологических ресурсов, если эти деяния повлекли массовую гибель рыбы или других водных биологических ресурсов, уничтожение в значительных размерах кормовых запасов либо иные тяжкие последствия).
Установлен запрет на осуществление работ, связанных с изменением дна и берегов реки Мзымта и вывозом песчано-гравийной смеси. В прокуратуре Краснодарского края сообщили, что ситуация находится на особом контроле.