Сейчас река Темерник оценивается специалистами как экстремально загрязненная. На первом этапе проводилась очистка русла реки от донных отложений. Однако возникли две проблемы. Первая очевидна всем: непонятно, как утилизировать эти крайне загрязненные различными химическими веществами отложения. О второй говорят ученые: очистка русла приводит к вторичному загрязнению, при изъятии загрязненного ила он опять отравляет воду в реке.
Специалисты АзНИИРХ настаивают, что без полного исследования экосистемы реки Темерник проект ее возрождения, предусматривающий создание самого длинного рекреационного парка в Европе, не может быть выполнен.